重亜硫酸塩PCRの単一繊維の構造の多形SSCP

この方法はDNAのメチル化パターンを明らかにするためにDNAおよびPCRの単一のナトリウムの重亜硫酸塩の処置を繊維の構造の多形結合する。 プライマーはネイティブDNAの州の対応する領域でCpGのサイトがない重亜硫酸塩変換されたシーケンスにアニールするように設計されている。 SSCPがそれからメチル化され、unmethylated DNAからの増幅された製品間の相違を明らかにするのに使用されている。 この方法は大きく、容易にDNAのメチル化を非常に単に調査できる。 さらに、量的なデータは得ることができる。 残念ながら、時々、SSCPは結果の解釈を複雑にする塗りつけるパターンか2つ以上のバンドを作り出すことができる。 従って進む前にプロトコルを最適化することは重要である。

参照:

microsatelliteの不安定な状態を示すcolorectal癌の重亜硫酸塩の処置およびPCR単一繊維の構造の多形を使用してMaekawa等DNAのメチル化の分析。 Biochem Biophys Res Communの(1999年の) 262:671 - 676。